La reciente necesidad de utilizar modelos matemáticos en disciplinas como la Biología, Medicina, entre otras, ha estimulado el interés en el empleo de nuevas técnicas. El problema estriba en que muchos de estos modelos son extremadamente difíciles de conformar por una formula o ecuación matemática exacta y precisa debido a la complejidad de la estructura del sistema como por ejemplo la no linealidad, la incertidumbre y la aleatorización de los procesos reales. En este sentido, los sistemas de inferencia difusa permiten modelar procesos complejos o sistemas incompletos o inciertos. En este trabajo se evaluó el rendimiento de un sistema Web que permite simular Modelos de Inferencia Difusa (SWID, Sistema Web de Inferencia Difusa). Para ello se relacionó el número de peticiones y tiempo de procesamiento para comparar dos algoritmos difusos mediante un análisis de covarianza. El algoritmo con mejor rendimiento utiliza las reglas de clasificación con un factor de peso (W).