La Facultad de Medicina de la Universidad Autónoma de Yucatán tiene como misión formar recursos humanos capacitados para el manejo científico y humanista de los problemas de salud, comprometidos en la promoción de mejores niveles de vida. Contribuir al conocimiento científico de los problemas de Salud mediante la investigación y proponer alternativas de solución. Consolidar su influencia académica y cultural a fin de contribuir al mejoramiento de la calidad de vida y al desarrollo de las profesiones de Medicina, Nutrición y Rehabilitación.

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